人类心脏的照片插图

心脏的算法

一名应用数学专业的博士生开发了一种算法,可以让心脏细胞研究人员在几分钟内得到结果,而不是几小时。

约翰Jurkiewicz
约翰Jurkiewicz

约翰Jurkiewicz参与了数学科学系和倡导极光研究所.他的算法可以在一小部分时间内分离出有价值的实验数据,而此前科学家需要手工完成这项工作。

极光倡议实验室研究心脏细胞,用它们来测量心脏细胞的功能,帮助发育研究,并最终帮助进行药物测试。他们的工作包括对这些细胞进行电击并记录所发生的情况。但这时候事情就变得棘手了。

很难将某些组织的活动(称为场电位,或FP)与每个细胞的活动(称为动作电位,或AP)分开。与动作电位相关的频率是有价值的——心脏细胞的AP可以反映其活动和健康状况。

在Jurkiewicz发明他的算法之前,Advocate Aurora实验室的成员必须手工剔除那些有价值的信号。分析一天的实验需要一个下午的时间,他们要面对1tb的数据。“他们来找我们说,‘你们能帮忙吗?尤凯维奇说,他的指导老师是彼得Hinow他是牛津大学的数学教授文理学院.“所以我们想出了一种算法,可以自动分割这些数据流。

“事实证明AP和FP分类对数学家来说是很容易做到的,”Jurkiewicz说,他的论文被《心电学杂志》接受发表。他还指出,要在他的消费级笔记本电脑上运行该算法,这样研究人员就不需要一台超级计算机来使用该工具。他还用开源语言Python编写了该程序。

希诺说:“我们希望尽可能地使其易于使用。”